Основными направлениями деятельности отдела являются:
    производство судебных пожарно-технических экспертиз и исследований в области экспертизы пожаров;
    научно-методическое руководство деятельностью судебно-экспертных учреждений федеральной противопожарной службы (СЭУ ФПС) "Испытательная пожарная лаборатория" (ИПЛ) в области исследования и экспертизы пожаров. 
Специалистами отдела проводятся экспертные исследования по уголовным, гражданским, арбитражным делам о пожарах и нарушениях правил пожарной безопасности (пожарно-технические экспертизы).
 
В рамках проведения экспертных исследований осуществляется:
    оперативный выезд специалистов на место пожара, произошедшего на объекте;
    помощь в обнаружении и изъятии объектов, причастных к возникновению пожара;
    осмотр места пожара;
    фото, видеосъемка;
    установление очага и причины пожара.
 
Сотрудники отдела экспертизы пожаров занимаются организацией процесса обучения и аттестации пожарно-технических специалистов по различным специализациям, которые систематически проводятся на базе ИЦЭП, а также проведением конкурсов на звание "Лучшее судебно-экспертное учреждение федеральной противопожарной службы "Испытательная пожарная лаборатория"" и "Лучший эксперт судебно-экспертного учреждения федеральной противопожарной службы "Испытательная пожарная лаборатория"".